L’Unità Operativa Complessa Centri di Referenza Nazionale coordina le attività di centri di Referenza Nazionale assegnati dal Ministero della Salute all’Istituto con i compiti e le competenze specificamente indicati dai relativi decreti di assegnazione. I centri svolgono inoltre attività di ricerca e cooperazione ed analisi epidemiologica relativa alle patologie di interesse. L’Unità Operativa Complessa gestisce inoltre il laboratorio di virologia, che garantisce gli aspetti diagnostici e di ricerca relativi alle principali malattie virali degli animali domestici, da affezione, selvatici e sinantropi.